① 轉錄組原始數據包括什麼
轉錄組原始數據包括遞交原始序列。
轉錄組有兩部分數據要遞交,首先是拼接的轉錄組序列,一般遞交到tsa上,另一個是fastq的原始測序數據,一般遞交到sra上。前兩年還有論文只提交tsa不遞交原始數據,目前發表的論文基本都要提交。這也是便於其他人可以完全重復你的實驗和數據分析的必要要求。
簡介
GSA(Genome Sequence Archive)是一個存儲基因組、轉錄組以及其他Omics原始序列數據的資料庫。GSA允許用戶創建、上傳並存儲序列數據。GSA提供對項目信息(BioProject)、樣本信息(BioSample)、實驗信息(Experiment)以及測序數據的有效組織與管理。