A. 4個腫瘤方向資料庫，手把手教你如何進行生信數據挖掘，不進實驗室就把文章發了！
在生信領域，SCI論文的發表不僅能夠幫助學術生涯的提升，還能為後續研究提供資金支持。生信數據挖掘作為一項熱門的科研方法，其主要目標是將公開資料庫中的原始數據加工轉化為具有科學價值的信息。然而，面對龐大的資料庫資源，如何從中篩選出有意義的數據，成為了這一研究過程中的關鍵挑戰。
本文將介紹四個專注於腫瘤研究的資料庫，以協助生信數據挖掘新手輕松入門。這些資料庫不僅提供了豐富的數據資源，還簡化了數據獲取和分析的過程，使得研究者無需進入實驗室即可發表高質量的SCI論文。
1. CancerSEA
CancerSEA是一個專為單細胞測序數據設計的資料庫，旨在探索癌細胞在單細胞水平上的不同功能狀態。通過整合來自SRA、GEO和ArrayExpress等網站的72個數據集，CancerSEA收錄了25種癌症類型的41900個腫瘤細胞，並根據HCMDB、Cyclebase和StemMapper等數據集重新定義了14種功能狀態。用戶可以通過「gene search」、「State Search」、「Browse state atlas」、「Browse dataset information」和「Download」等功能進行數據探索。
2. COSMIC
COSMIC是目前最大的癌症相關體細胞突變位點資料庫之一，收集了數千個與癌症發展相關的體細胞突變。數據來源於文獻和癌症基因組計劃的全基因組重測序研究。用戶可以通過搜索框輸入基因或蛋白名稱，查看具體記錄。
3. MEXPRESS
MEXPRESS是一個可視化TCGA資料庫中患者臨床信息、甲基化和表達關系的資料庫。通過輸入基因名和研究的腫瘤類型，用戶可以輕松獲取相關數據。MEXPRESS與cBioPortal、Xena、TSVdb等工具相比，提供了DNA甲基化數據查詢、基因組位置和臨床信息查看的綜合功能，並顯示相關性和矯正的p值。
4. miRWalk3.0
miRWalk是一個整合了人、小鼠等物種的miRNA靶基因信息的資料庫，涵蓋了預測和實驗驗證過的數據。它使用流行的TarPmiR預測miRNA的結合位點，並支持用戶搜索miRNA、mRNA單個或多個，提供了可視化、表格和富集分析結果，便於研究者研究感興趣的miRNA靶基因或mRNA結合的miRNA。
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