A. U盘拿来做系统启动盘了还可以存放其它文件吗
U盘制作了启动盘后是可以存放其它文件的。
制作了系统安装启动盘的U盘，系统区是隐藏式的，直观上看就是一个普通U盘，操作上也和普通U盘一样。
可以先备份U盘内的重要数据文件，然后用大白菜、电脑店之类的启动盘制作工具按默认的设置将U盘制作为启动盘，就可以即是启动盘，也不影响向U盘内存储文件了。
(1)u盘制作系统还可以装其他文件吗扩展阅读：
现在大多数用户都是通过HDD类软件制作成的HDD方式的PE系统启动盘，这种启动盘的系统分区是隐藏的，正常情况下是看不到的，PE系统只是修改了U盘启动引导区和一些必备文件。在电脑上所显示的就是一个普通U盘分区，因此拿来正常储存文件是没有问题的。
U盘装系统的时候，要选择磁盘格式（即U盘格式），通常都是选择FAT32格式的，有些它也会自动默认为FAT32格式；当然，有时也要用到NTFS格式，尤其是装win7系统的时候，可能就要用到NTFS格式，因为FAT32格式的U盘不允许存放4G以上大小的文件数据的。
B. U盘变成系统盘后还能存储其他东西吗
可以的，只要你的U盘空间充足，做成U盘启动盘+系统以后，仍然可以放一些工具和软件，或者共它版本的系统，只要不超出U盘的容量就可以的。（如下图）
C. 做系统的U盘可以存放别的东西吗
可以，只要有地方放，可以在U盘的根目录下建立一个文件夹（如：我的资料），然后将资料都放在里面，当然在不破坏U盘里系统的前提下。
U盘集磁盘存储技术、闪存技术及通用串行总线技术于一体。USB的端口连接电脑，是数据输入/输出的通道；主控芯片使计算机将U盘识别为可移动磁盘，是U盘的“大脑”。
U盘Flash（闪存）芯片保存数据，与计算机的内存不同，即使在断电后数据也不会丢失；PCB底板将各部件连接在一起，并提供数据处理的平台。
(3)u盘制作系统还可以装其他文件吗扩展阅读：
相较于其他可携式存储设备，闪存U盘有许多优点：占空间小，通常操作速度较快(USB1.1、2.0、3.0标准)，能存储较多数据，并且性能较可靠(由于没有机械设备)，在读写时断开而不会损坏硬件(软盘在读写时断开马上损坏)，只会丢失数据。
这类的磁盘使用USB大量存储设备标准，在近代的操作系统如 Linux、 Mac OS X、Unix与 Windows200、XP、Win7中皆有内置支持。