1. U盘做启动盘后，还可以在里面放东西吗会不会影响。
可以的，不影响。
U盘制作了启动盘后是可以存放其它文件的，在安装系统时没有影响。U盘作为启动盘，如果是PE，本来就需要在里面放任何需要的文件。
制作了u装机启动U盘，只要空间足够，都可以放别的文件，为了避免混乱，可以建立一个文件夹来存放，在安装系统时，别的文件不会影响安装系统过程。
PE只是修改了启动引导区和一些必备文件，其它的部分，都可以放任意文件。如果是ISO文件写入的微软原版光盘，也可以放其它文件。但最好新建一个文件夹，统一安置，这样比较容易找到。
(1)u盘两个系统可以放一个文件夹吗扩展阅读
制作了系统安装启动盘的U盘，系统区是隐藏式的，直观上看就是一个普通U盘，操作上也和普通U盘一样。注意对启动U盘的病毒防护，因为涉及到系统安装和维护，所以不要让病毒感染到启动盘，以免出现安装维护后的系统被U盘病毒感觉的情况。
对于原版系统制作的启动盘，U盘里面会有这些系统文件，这些文件不要移动，静静放那边就好，如果要放别的文件，同样的道理，再建立新的文件夹来存放。只要框起来的文件没有移动，安装系统是不影响的。
2. 做系统的U盘可以存放别的东西吗
可以，只要有地方放，可以在U盘的根目录下建立一个文件夹（如：我的资料），然后将资料都放在里面，当然在不破坏U盘里系统的前提下。
U盘集磁盘存储技术、闪存技术及通用串行总线技术于一体。USB的端口连接电脑，是数据输入/输出的通道；主控芯片使计算机将U盘识别为可移动磁盘，是U盘的“大脑”。
U盘Flash（闪存）芯片保存数据，与计算机的内存不同，即使在断电后数据也不会丢失；PCB底板将各部件连接在一起，并提供数据处理的平台。
(2)u盘两个系统可以放一个文件夹吗扩展阅读：
相较于其他可携式存储设备，闪存U盘有许多优点：占空间小，通常操作速度较快(USB1.1、2.0、3.0标准)，能存储较多数据，并且性能较可靠(由于没有机械设备)，在读写时断开而不会损坏硬件(软盘在读写时断开马上损坏)，只会丢失数据。
这类的磁盘使用USB大量存储设备标准，在近代的操作系统如 Linux、 Mac OS X、Unix与 Windows200、XP、Win7中皆有内置支持。
3. 用一键U盘装系统制作好启动盘后剩余的U盘空间可以直接放别的文件吗
可以直接放入任何东西。因为制作U启时，会自动把U盘分成两个区，一个引导分区，一个逻辑分区，引导分区是隐藏的。所以逻辑分区放任何东西都不会影响使用的。如还不放心，就另行创建文件夹，着名是装什么的，这样就可以方便你找到你想找的文件而不会乱了。